A Tapajós Expresso conta com as áreas administrativas e de produção, compostas por marinheiros, equipe de manutenção, bilheteiros e uma área comercial. Em suas diversas atribuições, todos eles trabalham pela segurança e pela satisfação dos clientes. A empresa tem, ainda, a parceria de agentes de venda de passagens, distribuídos em mais de dez cidades ao longo do percurso das linhas.
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